1. 生物芯片上海國家工程研究中心樣本庫分中心

與生物芯片上海國家工程研究中心合作在中西醫交融領域，就銀屑病等皮膚病、體質、肝病、腎病、代謝性疾病、脊髓型頸椎病、前列腺疾病等領域分期、分階段開展系列合作研究，並聯合創辦生物芯片上海國家工程研究中心生物樣本庫分中心。2019年9月我院生物樣本庫通過中國合格評定國家認可委員會ISO20387生物樣本庫國際標準認可現場評審工作。

2. 華大基因聯合實驗室

2016年與深圳華大臨牀檢驗中心有限公司合作共建廣東省中醫院-華大基因聯合實驗室。2019年聯合實驗室通過國家衛健委臨牀檢驗中心基因檢測室間質量評價（外周血胎兒染色體非整倍體（T21,T18和T13）高通量測序檢測室間質量評價、全國腫瘤體細胞突變高通量測序檢測時間質量評價、全國BRCA1/2基因突變（胚系）檢測室間質量評價）。聯合實驗室現已開展了病原微生物快檢等基因檢測項目，肺癌和遺傳性腫瘤相關的生物信息分析流程。並開設了基因檢測與諮詢門診，爲患者提供了相關的諮詢服務。

3. 國家蛋白質組研究中心（北京）

2017年廣東省中醫院與國家蛋白質組研究中心（北京）共同創辦具有國內領先水平和國際影響力的中醫藥蛋白質組研究中心，開展蛋白質組學與中醫藥學相關領域的合作研究。已開展五個聯合方向研究（銀屑病、糖尿病腎病、高尿酸血癥、高脂血症、結腸癌術後），並在人才培養、學術交流、專家互訪等多方面開展合作，已共同培養博士研究生多名。